Compte tenu des conditions de fonctionnement des voitures modernes, le système de climatisation est un appareil assez vulnérable. Son dysfonctionnement peut être indiqué par des arrêts du compresseur, l'apparition de taches d'huile, une surchauffe du moteur, le glissement de l'embrayage électromagnétique et de la courroie d'entraînement, l'apparition de gouttelettes d'eau et une odeur désagréable dans l'habitacle, une augmentation du bruit lors de la climatisation, généralement faible rendement, congélation des tubes de l'évaporateur, des tuyaux sortants et du filtre. Un mauvais assemblage, des dommages mécaniques et un impact environnemental, une mauvaise utilisation, l'épuisement de sa ressource et bien d'autres raisons peuvent être à l'origine de pannes. Certains éléments peuvent être réparés ou remplacés. Parfois, il est nécessaire de remplacer le système de climatisation.